1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）
猪圆环病毒病（PCVD）是猪2型圆环病毒（Porcine circovirus type 2）引起的以PMWS（断乳仔猪多系统衰竭综合征）为代表的多种疾病的统称。Tischer于1974年首次从猪肾传代细胞系PK-15中分离出来PCV，但其致病性直到1991年才被加拿大Clark等报道。目前，该病在世界范围内广泛流行，并呈现多种临床病症，已经证实PCV-2可引起PMWS、猪皮炎和肾病综合征（PNDS）、增生性坏死性肺炎（PNP）、猪呼吸道疾病综合征（PRDC）、母猪繁殖障碍、仔猪传染性先天性震颤等多种疾病，以PMWS最为常见，成为影响养猪业发展的重要传染病之一。尽管大多数猪群感染和PCV-2有关，但有学者认为PCV-2的2个不同基因型在临床表现并不相同，即两者的毒力不同，普遍认为PCV-2b的致病性要强于PCV-2a（Hesse等，2008）；也有学者认为PCV-2a和PCV-2b的毒力没有差异，且二者存在交叉保护力（Opriessnig等，2008）。在1997年至2003年之间，PCV-2a基因型病毒占主导地位，而从2004年PMWS暴发之后，PCV-2b毒株变得越来越普遍。为了了解和摸清上海地区猪群中2型圆环病毒的感染状况，对2009-2012年采集地猪内脏样本进行PCV2检测。根据翟少伦等（2010）介绍的方法对PCV-2阳性样本进行2a/2b亚型的鉴定，同时进行流行病学分析，以便于在今后的工作过程中更好地指导上海地区猪场免疫计划的制定。
参考文献：
[1] 蒋志远.猪圆环病毒病及其预防[J]. 中国畜牧兽医文摘，2014，30(1)：98.
2. 研究的基本内容和问题
通过对29个PCV-2感染病例临床症状、病原学检测结果以及发病猪群与健康猪群PCV-2的检测结果的统计和分析，对上海地区猪2型圆环病毒病进行流行病学调查。
通过对245份PCV-2阳性样本的检测结果，判断上海地区猪群PCV-2感染的优势毒株，从而确定选择何种亚型毒株作为疫苗毒株。
由29株阳性样本的ORF2序列与已知序列进行对比以及将获得的PCV-2 ORF2基因核苷酸序列同已知的核苷酸序列绘制系统进化树，判断毒株是否呈地方流行态势。
3. 研究的方法与方案
于2009-2012年间，对本中心门出诊中已经临床检查和实验室诊断确认为PCV-2感染的29个病例进行统计和分析，了解PCV-2和其他病原的混合感染情况，同时进行临床追溯调查，了解发病猪的临床变现形式。
PCV-2a与PCV-2b荧光PCR分型试剂盒，由北京匹基公司提供。
对29个临床PCV-2阳性内脏样本提取PCV-2 DNA，扩增ORF2片断，并经克隆和鉴定。
4. 研究创新点
对阳性样本的ORF2序列与已知序列进行对比，确定各PCV-2分离株与已发表的PCV-2 ORF2核苷酸序列的同源性。
比较具体全面地从2009年至2012年期间，对上海地区猪群的PCV-2感染状况进行调查和分析。
5. 研究计划与进展
预计初期，完成临床发病情况的调查统计以及PCV-2和其他病原混合感染的调查结果；中期完成发病猪群和健康猪群荧光PCR对阳性样本的检测结果；后期完成核苷酸同源性分析以及系统发育树的绘制与分析，最后完成论文。
