1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)
大肠埃希氏菌(Escherichia coli, E. coli)即大肠杆菌;它作为一种普遍存在于生产生活中的细菌,能引起人畜共患,因此一直以来都备受重视,成为研究发现的重点,但始终无法非常清楚的将其了解透彻。
目前通常根据其致病机制分为三类:肠内致病型大肠杆菌,肠外致病型大肠杆菌以及共生型大肠杆菌[1]。
肠外致病性大肠杆菌目前引起人们的广泛关注,它是一类定植于宿主肠道外引起组织感染的重要人畜共患病病原,在人体内主要引起新生儿脑膜炎和肾盂肾炎,禽类则发生败血症及气囊炎等。
2. 研究的基本内容和问题
研究目标:希望通过对临床分离的肠外致病性大肠杆菌的研究,弄清ExPEC的背景知识,掌握ExPEC的流行病学规律,希望建立起一套简单有效的检测方法,为该病的诊断与防治打下基础。
研究对临床猪源肠外致病性大肠杆菌分离株进行药物敏感性及遗传相关性检测,以提供可靠的临床用药和防治依据。
内容:(1)细菌分离培养(2)生理生化反应(3)PCR检测及分群(4)毒力因子检测(5)溶血性检测药敏试验(6)药敏试验(7)血清学检测(8)小鼠毒力试验拟解决的关键问题:(1)设计引物,检测特征性毒力因子(2)筛选目标基因,建立可靠的PCR检测方法(3)学习并掌握细菌分离鉴定的方法(4)分析数据,总结流行病学规律
3. 研究的方法与方案
研究方法:PCR检测动物实验血清 学分析技术路线:从肠道外病料中分离纯化大肠杆菌-----设计引物------毒力因子检测及分子分群-------筛选菌株-------小鼠毒力试验------药敏试验--------基因组框架图测序及分析实验方案:细菌分离纯化:在麦康凯和伊红美兰平板上划线分离,分离得到大肠杆菌,挑取单菌落加入LB液体培养基,37℃,180rpm摇床振摇4小时。
再以1:1将菌液和冻存液混匀-70℃冻存菌种。
引物设计:根据已发表的肠外致病性大肠杆菌的毒力因子,参考文献或根据NCBI发表基因序列重新设计PCR检测:筛选特异性毒力因子,PCR检测鉴定是否属于肠外致病性大肠杆菌,建立相对可靠地检测方法。
4. 研究创新点
1.到目前为止,国内发病率愈高,但对于肠外致病性大肠杆菌的研究较少,对于此类细菌的基因序列,致病机制等都不清楚,这对该病的防治造成困难。
本课题可为后期针对该菌的进一步研究打下一个基础
5. 研究计划与进展
2月24日3月1日:查阅文献,了解国内外对于肠外致病性大肠杆菌的研究近况;登陆NCBI下载已发布的基因序列作为参考;参考文献中已知引物或自行设计;由上海桑尼公司合成;3月2日3月9日:细菌的复苏及分离纯化;3月10日3月25日:筛选毒力基因进行全部菌株的PCR检测以选出所需肠外致病性大肠杆菌,并进行种系发育的分群;3月26日3月31日:动物实验,测定毒力强弱;4月1日4月20日:药敏实验和溶血性检测;4月21日5月1日:强毒株全基因组框架图测序;5月2日5月25日:数据结果的汇总分析;结题论文编写
