1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）
1.1课题意义泥鳅（Misgurnus anguillicaudatus）和大鳞副泥鳅（Paramisgurnus dabryanus）统称为泥鳅，是中国重要的淡水经济鱼类，其肉质鲜美，营养丰富，富含蛋白质及多种维生素，属于高蛋白低脂肪食品，有利于人体抗血管衰老，素有水中人参的美誉。
但是由于长期的过度捕捞，以及天然水域生态环境日益恶化，导致我国野生泥鳅的产量逐渐下降。
近年来，随着人们对泥鳅营养价值认识的提高，泥鳅的市场需求也日益增加，各地泥鳅养殖业发展迅速。
2. 研究的基本内容和问题
2.1研究的目标从基因组水平上了解我国3种主养鳅类的分子遗传差异，并研究探讨台湾大泥鳅的遗传背景及归属。
2.2研究内容对3种主养鳅类的简化基因组SNP分析。
分别收集泥鳅、大鳞副泥鳅和台湾大泥鳅这3种主养鳅类的群体，采用IIB型内切酶BsaXI、通过选择性接头构建2b-RAD文库，并通过高通量测序平台对3种鳅群体进行简化基因组的SNP开发和分型。
3. 研究的方法与方案
3.1研究方法本研究计划基于简化基因组测序技术（2b-RAD）从我国3种主养鳅科鱼类的种质资源研究入手。
该技术应用ⅡB型内切酶来酶切基因组产生等长片段，并对其进行高通量测序，从而大幅度降低基因组的复杂度，同时不受有无参考基因组的限制，达到快速进行全基因组范围大规模SNP标记的开发和分型。
3.2技术路线提取3种主养鳅类的DNA并构建2b-RAD文库，对获取到的原始数据进行质控和数据过滤得到高质量数据，对产出的2b-RAD tag进行统计，构建高质量Ref tag，构建个体及群体聚类树，进行SNP标记分型及统计，比较3种主养鳅类的分子差异，进行野生鳅类群体的遗传变异分析。
4. 研究创新点
4.1创新之处本研究首次利用简化基因组SNP检测技术，对台湾大泥鳅的遗传背景进行研究，为有效安全利用该种质资源提供技术参考；并对鳅类野生资源进行遗传变异分析，为其后续的保护和开发利用提供数据支撑。
5. 研究计划与进展
5.1研究计划及预期进展2018年1月27日-2018年2月2 日3种泥鳅不同群体的收集；2018年2月3日-2018年2月9日 构建3种鳅2b-RAD文库；2018年2月10日-2018年2月19日 对泥鳅和大鳞副泥鳅全基因组进行SNP扫描，分析群体遗传结构和遗传多样性；2018年2月20日-2018年3月4日 SNP标记开发及分析；2018年3月10日-2018年3月20日 撰写项目报告。
